Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXD4Q12950 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD4Q12950 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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