Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFSWAPQ12872 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFSWAPQ12872 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFSWAPQ12872 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFSWAPQ12872 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFSWAPQ12872 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFSWAPQ12872 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SFSWAPQ12872 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFSWAPQ12872 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFSWAPQ12872 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFSWAPQ12872 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFSWAPQ12872 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SFSWAPQ12872 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFSWAPQ12872 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFSWAPQ12872 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SFSWAPQ12872 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
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