Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB40BQ12829 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB40BQ12829 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB40BQ12829 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB40BQ12829 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB40BQ12829 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB40BQ12829 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB40BQ12829 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB40BQ12829 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB40BQ12829 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB40BQ12829 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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