Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYCNQ0VAF6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCNQ0VAF6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYCNQ0VAF6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms