Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NIPAL4Q0D2K0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIPAL4Q0D2K0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms