Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GABPAQ06546 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GABPAQ06546 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GABPAQ06546 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GABPAQ06546 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms