Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CSTF1Q05048 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSTF1Q05048 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSTF1Q05048 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSTF1Q05048 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF1Q05048 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms