Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBE1Q04446 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBE1Q04446 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GBE1Q04446 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBE1Q04446 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBE1Q04446 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBE1Q04446 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBE1Q04446 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBE1Q04446 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBE1Q04446 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBE1Q04446 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBE1Q04446 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBE1Q04446 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBE1Q04446 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBE1Q04446 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBE1Q04446 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBE1Q04446 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms