Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PMP22Q01453 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms