Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK16Q00536 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK16Q00536 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK16Q00536 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK16Q00536 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK16Q00536 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms