Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2C1P98194 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2C1P98194 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2C1P98194 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2C1P98194 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2C1P98194 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2C1P98194 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2C1P98194 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2C1P98194 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2C1P98194 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2C1P98194 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP2C1P98194 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2C1P98194 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2C1P98194 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms