Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SKOR1P84550 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKOR1P84550 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKOR1P84550 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKOR1P84550 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms