Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUCB2P80303 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUCB2P80303 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
NUCB2P80303 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NUCB2P80303 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUCB2P80303 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms