Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB1P62873 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB1P62873 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB1P62873 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNB1P62873 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNB1P62873 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNB1P62873 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNB1P62873 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNB1P62873 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNB1P62873 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNB1P62873 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB1P62873 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB1P62873 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB1P62873 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB1P62873 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB1P62873 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB1P62873 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB1P62873 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GNB1P62873 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNB1P62873 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNB1P62873 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNB1P62873 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNB1P62873 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNB1P62873 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNB1P62873 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNB1P62873 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GNB1P62873 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNB1P62873 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNB1P62873 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNB1P62873 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNB1P62873 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNB1P62873 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNB1P62873 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNB1P62873 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNB1P62873 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB1P62873 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB1P62873 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB1P62873 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB1P62873 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB1P62873 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB1P62873 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB1P62873 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNB1P62873 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNB1P62873 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNB1P62873 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNB1P62873 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNB1P62873 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNB1P62873 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNB1P62873 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNB1P62873 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNB1P62873 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNB1P62873 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNB1P62873 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GNB1P62873 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNB1P62873 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB1P62873 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB1P62873 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB1P62873 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB1P62873 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB1P62873 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNB1P62873 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB1P62873 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB1P62873 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB1P62873 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB1P62873 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB1P62873 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GNB1P62873 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB1P62873 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB1P62873 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB1P62873 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB1P62873 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB1P62873 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB1P62873 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB1P62873 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GNB1P62873 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB1P62873 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB1P62873 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB1P62873 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB1P62873 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB1P62873 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB1P62873 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB1P62873 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB1P62873 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GNB1P62873 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GNB1P62873 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB1P62873 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB1P62873 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB1P62873 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB1P62873 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB1P62873 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB1P62873 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB1P62873 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GNB1P62873 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNB1P62873 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNB1P62873 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GNB1P62873 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GNB1P62873 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNB1P62873 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNB1P62873 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNB1P62873 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms