Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HERVK_113P62684 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERVK_113P62684 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERVK_113P62684 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HERVK_113P62684 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms