Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RPS29P62273 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RPS29P62273 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RPS29P62273 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RPS29P62273 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RPS29P62273 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RPS29P62273 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RPS29P62273 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RPS29P62273 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RPS29P62273 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RPS29P62273 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RPS29P62273 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RPS29P62273 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RPS29P62273 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RPS29P62273 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RPS29P62273 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RPS29P62273 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RPS29P62273 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RPS29P62273 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RPS29P62273 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RPS29P62273 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RPS29P62273 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RPS29P62273 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RPS29P62273 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RPS29P62273 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RPS29P62273 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RPS29P62273 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RPS29P62273 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RPS29P62273 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RPS29P62273 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RPS29P62273 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RPS29P62273 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RPS29P62273 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RPS29P62273 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RPS29P62273 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RPS29P62273 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RPS29P62273 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPS29P62273 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPS29P62273 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPS29P62273 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPS29P62273 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPS29P62273 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPS29P62273 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPS29P62273 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPS29P62273 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPS29P62273 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPS29P62273 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPS29P62273 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPS29P62273 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPS29P62273 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPS29P62273 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPS29P62273 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPS29P62273 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPS29P62273 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPS29P62273 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPS29P62273 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPS29P62273 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPS29P62273 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPS29P62273 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPS29P62273 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPS29P62273 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPS29P62273 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPS29P62273 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPS29P62273 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPS29P62273 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPS29P62273 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPS29P62273 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPS29P62273 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPS29P62273 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPS29P62273 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPS29P62273 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPS29P62273 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPS29P62273 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPS29P62273 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RPS29P62273 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPS29P62273 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPS29P62273 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RPS29P62273 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPS29P62273 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPS29P62273 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPS29P62273 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPS29P62273 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPS29P62273 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPS29P62273 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPS29P62273 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RPS29P62273 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPS29P62273 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RPS29P62273 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RPS29P62273 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPS29P62273 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RPS29P62273 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPS29P62273 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPS29P62273 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPS29P62273 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPS29P62273 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RPS29P62273 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPS29P62273 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPS29P62273 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPS29P62273 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPS29P62273 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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