Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2MP61081 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2MP61081 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE2MP61081 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms