Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX8P57073 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX8P57073 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX8P57073 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX8P57073 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX8P57073 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX8P57073 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX8P57073 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX8P57073 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX8P57073 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX8P57073 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX8P57073 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX8P57073 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX8P57073 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX8P57073 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX8P57073 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX8P57073 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX8P57073 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX8P57073 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX8P57073 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX8P57073 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX8P57073 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX8P57073 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX8P57073 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX8P57073 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX8P57073 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX8P57073 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX8P57073 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX8P57073 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX8P57073 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX8P57073 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX8P57073 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX8P57073 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX8P57073 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX8P57073 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX8P57073 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX8P57073 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX8P57073 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX8P57073 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX8P57073 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX8P57073 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX8P57073 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX8P57073 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX8P57073 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX8P57073 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX8P57073 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX8P57073 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX8P57073 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX8P57073 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX8P57073 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX8P57073 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX8P57073 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX8P57073 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX8P57073 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX8P57073 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX8P57073 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX8P57073 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX8P57073 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX8P57073 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX8P57073 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX8P57073 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX8P57073 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX8P57073 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX8P57073 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX8P57073 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX8P57073 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX8P57073 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX8P57073 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX8P57073 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX8P57073 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX8P57073 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX8P57073 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX8P57073 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX8P57073 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX8P57073 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX8P57073 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX8P57073 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX8P57073 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX8P57073 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX8P57073 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX8P57073 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX8P57073 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX8P57073 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX8P57073 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX8P57073 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX8P57073 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX8P57073 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX8P57073 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX8P57073 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX8P57073 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX8P57073 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX8P57073 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX8P57073 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX8P57073 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX8P57073 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX8P57073 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX8P57073 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX8P57073 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX8P57073 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX8P57073 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms