Protein–RNA interactions for Protein: P56880

CLDN20, Claudin-20, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN20P56880 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDN20P56880 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN20P56880 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN20P56880 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms