Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAV3P56539 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV3P56539 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV3P56539 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV3P56539 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV3P56539 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAV3P56539 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV3P56539 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV3P56539 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV3P56539 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV3P56539 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV3P56539 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV3P56539 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV3P56539 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV3P56539 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV3P56539 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV3P56539 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAV3P56539 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAV3P56539 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CAV3P56539 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV3P56539 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV3P56539 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV3P56539 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV3P56539 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV3P56539 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV3P56539 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV3P56539 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV3P56539 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV3P56539 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV3P56539 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV3P56539 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV3P56539 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV3P56539 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV3P56539 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV3P56539 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV3P56539 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV3P56539 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV3P56539 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV3P56539 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV3P56539 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAV3P56539 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAV3P56539 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAV3P56539 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAV3P56539 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAV3P56539 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAV3P56539 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAV3P56539 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAV3P56539 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAV3P56539 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAV3P56539 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAV3P56539 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAV3P56539 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAV3P56539 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAV3P56539 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAV3P56539 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAV3P56539 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAV3P56539 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CAV3P56539 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAV3P56539 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAV3P56539 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAV3P56539 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAV3P56539 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAV3P56539 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAV3P56539 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAV3P56539 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAV3P56539 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAV3P56539 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAV3P56539 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAV3P56539 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAV3P56539 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAV3P56539 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAV3P56539 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAV3P56539 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAV3P56539 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAV3P56539 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAV3P56539 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAV3P56539 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAV3P56539 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAV3P56539 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAV3P56539 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAV3P56539 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAV3P56539 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAV3P56539 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CAV3P56539 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CAV3P56539 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAV3P56539 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAV3P56539 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAV3P56539 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAV3P56539 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAV3P56539 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV3P56539 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV3P56539 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV3P56539 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV3P56539 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAV3P56539 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV3P56539 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV3P56539 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV3P56539 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV3P56539 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAV3P56539 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms