Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AP1S2P56377 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP1S2P56377 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1S2P56377 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms