Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH13P55290 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH13P55290 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH13P55290 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH13P55290 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH13P55290 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH13P55290 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH13P55290 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH13P55290 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH13P55290 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH13P55290 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH13P55290 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH13P55290 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH13P55290 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH13P55290 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH13P55290 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH13P55290 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH13P55290 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH13P55290 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH13P55290 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH13P55290 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH13P55290 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH13P55290 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH13P55290 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH13P55290 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH13P55290 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH13P55290 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH13P55290 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH13P55290 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH13P55290 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH13P55290 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH13P55290 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH13P55290 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH13P55290 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH13P55290 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH13P55290 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH13P55290 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH13P55290 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH13P55290 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH13P55290 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH13P55290 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH13P55290 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH13P55290 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH13P55290 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH13P55290 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH13P55290 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH13P55290 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH13P55290 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH13P55290 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH13P55290 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH13P55290 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH13P55290 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH13P55290 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH13P55290 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH13P55290 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH13P55290 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH13P55290 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH13P55290 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH13P55290 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH13P55290 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH13P55290 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH13P55290 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH13P55290 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH13P55290 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH13P55290 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH13P55290 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH13P55290 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH13P55290 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH13P55290 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH13P55290 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH13P55290 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH13P55290 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH13P55290 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH13P55290 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH13P55290 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH13P55290 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH13P55290 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH13P55290 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH13P55290 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH13P55290 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH13P55290 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH13P55290 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH13P55290 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH13P55290 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH13P55290 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH13P55290 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH13P55290 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH13P55290 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH13P55290 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH13P55290 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH13P55290 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH13P55290 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH13P55290 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH13P55290 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH13P55290 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH13P55290 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH13P55290 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH13P55290 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH13P55290 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH13P55290 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms