Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP9P55211 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP9P55211 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP9P55211 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP9P55211 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP9P55211 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP9P55211 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP9P55211 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP9P55211 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP9P55211 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP9P55211 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP9P55211 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP9P55211 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP9P55211 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP9P55211 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP9P55211 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP9P55211 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP9P55211 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP9P55211 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP9P55211 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP9P55211 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP9P55211 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP9P55211 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP9P55211 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP9P55211 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP9P55211 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP9P55211 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP9P55211 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP9P55211 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP9P55211 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP9P55211 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP9P55211 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP9P55211 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP9P55211 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP9P55211 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP9P55211 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP9P55211 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP9P55211 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP9P55211 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP9P55211 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP9P55211 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP9P55211 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP9P55211 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP9P55211 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP9P55211 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP9P55211 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP9P55211 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP9P55211 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP9P55211 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP9P55211 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP9P55211 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP9P55211 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP9P55211 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP9P55211 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP9P55211 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP9P55211 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP9P55211 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP9P55211 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP9P55211 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP9P55211 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP9P55211 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP9P55211 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP9P55211 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP9P55211 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP9P55211 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP9P55211 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP9P55211 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP9P55211 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP9P55211 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP9P55211 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP9P55211 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP9P55211 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP9P55211 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP9P55211 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP9P55211 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP9P55211 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP9P55211 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP9P55211 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP9P55211 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP9P55211 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP9P55211 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP9P55211 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP9P55211 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP9P55211 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP9P55211 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP9P55211 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP9P55211 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP9P55211 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP9P55211 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP9P55211 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP9P55211 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP9P55211 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP9P55211 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP9P55211 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP9P55211 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP9P55211 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP9P55211 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP9P55211 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP9P55211 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP9P55211 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms