Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC12A3P55017 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC12A3P55017 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms