Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP12AP54707 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP12AP54707 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP12AP54707 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms