Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IST1P53990 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IST1P53990 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IST1P53990 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IST1P53990 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IST1P53990 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IST1P53990 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IST1P53990 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IST1P53990 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IST1P53990 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IST1P53990 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IST1P53990 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IST1P53990 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IST1P53990 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IST1P53990 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IST1P53990 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IST1P53990 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IST1P53990 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IST1P53990 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IST1P53990 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IST1P53990 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IST1P53990 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IST1P53990 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IST1P53990 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IST1P53990 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IST1P53990 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IST1P53990 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IST1P53990 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IST1P53990 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IST1P53990 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IST1P53990 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IST1P53990 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IST1P53990 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IST1P53990 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IST1P53990 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IST1P53990 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IST1P53990 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IST1P53990 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IST1P53990 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IST1P53990 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IST1P53990 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IST1P53990 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IST1P53990 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IST1P53990 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IST1P53990 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IST1P53990 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IST1P53990 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IST1P53990 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IST1P53990 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IST1P53990 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IST1P53990 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IST1P53990 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IST1P53990 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IST1P53990 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IST1P53990 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IST1P53990 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IST1P53990 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IST1P53990 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IST1P53990 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IST1P53990 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IST1P53990 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IST1P53990 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IST1P53990 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IST1P53990 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IST1P53990 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IST1P53990 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IST1P53990 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IST1P53990 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IST1P53990 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IST1P53990 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IST1P53990 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IST1P53990 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IST1P53990 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IST1P53990 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IST1P53990 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IST1P53990 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IST1P53990 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IST1P53990 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IST1P53990 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IST1P53990 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IST1P53990 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IST1P53990 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IST1P53990 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IST1P53990 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IST1P53990 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IST1P53990 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IST1P53990 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IST1P53990 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IST1P53990 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IST1P53990 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IST1P53990 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IST1P53990 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IST1P53990 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IST1P53990 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IST1P53990 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IST1P53990 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IST1P53990 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IST1P53990 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IST1P53990 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IST1P53990 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms