Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR2KP53803 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2KP53803 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms