Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF143P52747 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF143P52747 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF143P52747 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF143P52747 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms