Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BCAMP50895 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BCAMP50895 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCAMP50895 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCAMP50895 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCAMP50895 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCAMP50895 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCAMP50895 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCAMP50895 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCAMP50895 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCAMP50895 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCAMP50895 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCAMP50895 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCAMP50895 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCAMP50895 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCAMP50895 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCAMP50895 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCAMP50895 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCAMP50895 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
BCAMP50895 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCAMP50895 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCAMP50895 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCAMP50895 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCAMP50895 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCAMP50895 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BCAMP50895 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BCAMP50895 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BCAMP50895 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BCAMP50895 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BCAMP50895 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCAMP50895 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCAMP50895 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCAMP50895 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCAMP50895 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BCAMP50895 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BCAMP50895 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BCAMP50895 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BCAMP50895 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCAMP50895 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCAMP50895 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
BCAMP50895 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
BCAMP50895 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCAMP50895 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCAMP50895 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCAMP50895 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCAMP50895 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCAMP50895 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCAMP50895 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCAMP50895 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCAMP50895 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCAMP50895 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCAMP50895 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
BCAMP50895 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
BCAMP50895 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCAMP50895 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCAMP50895 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
BCAMP50895 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCAMP50895 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCAMP50895 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCAMP50895 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCAMP50895 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCAMP50895 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCAMP50895 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BCAMP50895 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCAMP50895 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCAMP50895 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCAMP50895 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCAMP50895 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCAMP50895 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCAMP50895 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCAMP50895 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCAMP50895 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCAMP50895 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCAMP50895 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCAMP50895 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BCAMP50895 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
BCAMP50895 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BCAMP50895 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
BCAMP50895 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCAMP50895 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCAMP50895 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCAMP50895 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCAMP50895 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCAMP50895 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCAMP50895 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCAMP50895 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCAMP50895 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCAMP50895 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
BCAMP50895 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCAMP50895 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCAMP50895 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCAMP50895 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCAMP50895 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCAMP50895 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCAMP50895 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCAMP50895 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCAMP50895 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCAMP50895 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCAMP50895 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BCAMP50895 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms