Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSK3BP49841 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GSK3BP49841 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSK3BP49841 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSK3BP49841 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms