Protein–RNA interactions for Protein: P49754

VPS41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS41P49754 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS41P49754 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS41P49754 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS41P49754 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS41P49754 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS41P49754 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS41P49754 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS41P49754 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS41P49754 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS41P49754 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS41P49754 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS41P49754 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS41P49754 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS41P49754 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS41P49754 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS41P49754 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS41P49754 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS41P49754 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS41P49754 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS41P49754 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS41P49754 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS41P49754 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS41P49754 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS41P49754 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS41P49754 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS41P49754 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS41P49754 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS41P49754 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS41P49754 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS41P49754 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS41P49754 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS41P49754 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS41P49754 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS41P49754 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS41P49754 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS41P49754 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS41P49754 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS41P49754 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS41P49754 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS41P49754 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS41P49754 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS41P49754 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS41P49754 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS41P49754 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS41P49754 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS41P49754 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS41P49754 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS41P49754 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS41P49754 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS41P49754 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS41P49754 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS41P49754 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS41P49754 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS41P49754 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS41P49754 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS41P49754 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS41P49754 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS41P49754 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS41P49754 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS41P49754 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS41P49754 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS41P49754 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS41P49754 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS41P49754 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS41P49754 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS41P49754 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS41P49754 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS41P49754 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS41P49754 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS41P49754 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS41P49754 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS41P49754 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS41P49754 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS41P49754 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS41P49754 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS41P49754 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS41P49754 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS41P49754 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS41P49754 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS41P49754 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS41P49754 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS41P49754 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS41P49754 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS41P49754 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS41P49754 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS41P49754 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS41P49754 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS41P49754 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS41P49754 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS41P49754 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS41P49754 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS41P49754 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS41P49754 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS41P49754 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS41P49754 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS41P49754 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS41P49754 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS41P49754 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS41P49754 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS41P49754 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms