Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCP4P48539 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCP4P48539 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCP4P48539 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCP4P48539 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCP4P48539 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCP4P48539 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCP4P48539 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PCP4P48539 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCP4P48539 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCP4P48539 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCP4P48539 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCP4P48539 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCP4P48539 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCP4P48539 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCP4P48539 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCP4P48539 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCP4P48539 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCP4P48539 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCP4P48539 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCP4P48539 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCP4P48539 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCP4P48539 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCP4P48539 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCP4P48539 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCP4P48539 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCP4P48539 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCP4P48539 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCP4P48539 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCP4P48539 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCP4P48539 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PCP4P48539 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCP4P48539 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCP4P48539 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCP4P48539 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCP4P48539 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCP4P48539 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCP4P48539 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCP4P48539 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCP4P48539 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCP4P48539 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCP4P48539 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCP4P48539 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCP4P48539 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCP4P48539 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCP4P48539 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCP4P48539 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCP4P48539 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCP4P48539 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCP4P48539 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCP4P48539 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCP4P48539 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCP4P48539 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCP4P48539 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCP4P48539 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCP4P48539 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCP4P48539 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCP4P48539 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCP4P48539 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCP4P48539 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCP4P48539 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCP4P48539 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCP4P48539 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCP4P48539 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCP4P48539 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCP4P48539 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCP4P48539 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCP4P48539 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCP4P48539 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCP4P48539 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCP4P48539 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCP4P48539 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCP4P48539 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCP4P48539 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCP4P48539 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCP4P48539 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCP4P48539 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCP4P48539 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCP4P48539 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCP4P48539 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCP4P48539 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCP4P48539 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCP4P48539 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCP4P48539 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCP4P48539 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCP4P48539 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCP4P48539 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCP4P48539 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCP4P48539 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCP4P48539 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PCP4P48539 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCP4P48539 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCP4P48539 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCP4P48539 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCP4P48539 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCP4P48539 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCP4P48539 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCP4P48539 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCP4P48539 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCP4P48539 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms