Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX2P48431 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX2P48431 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX2P48431 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX2P48431 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX2P48431 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX2P48431 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX2P48431 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX2P48431 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX2P48431 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX2P48431 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX2P48431 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX2P48431 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX2P48431 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX2P48431 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOX2P48431 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX2P48431 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX2P48431 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX2P48431 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX2P48431 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX2P48431 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SOX2P48431 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX2P48431 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX2P48431 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX2P48431 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX2P48431 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX2P48431 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX2P48431 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX2P48431 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX2P48431 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX2P48431 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX2P48431 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX2P48431 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX2P48431 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX2P48431 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX2P48431 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX2P48431 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX2P48431 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX2P48431 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX2P48431 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX2P48431 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX2P48431 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX2P48431 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX2P48431 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX2P48431 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX2P48431 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX2P48431 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX2P48431 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOX2P48431 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SOX2P48431 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX2P48431 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX2P48431 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX2P48431 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX2P48431 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX2P48431 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX2P48431 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX2P48431 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX2P48431 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX2P48431 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX2P48431 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX2P48431 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX2P48431 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX2P48431 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX2P48431 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX2P48431 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX2P48431 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX2P48431 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX2P48431 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX2P48431 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX2P48431 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX2P48431 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX2P48431 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX2P48431 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOX2P48431 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX2P48431 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX2P48431 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX2P48431 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX2P48431 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX2P48431 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX2P48431 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX2P48431 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX2P48431 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX2P48431 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX2P48431 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX2P48431 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX2P48431 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX2P48431 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX2P48431 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX2P48431 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX2P48431 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX2P48431 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX2P48431 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX2P48431 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX2P48431 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX2P48431 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX2P48431 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX2P48431 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX2P48431 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX2P48431 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX2P48431 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms