Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XCR1P46094 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XCR1P46094 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
XCR1P46094 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XCR1P46094 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XCR1P46094 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XCR1P46094 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XCR1P46094 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
XCR1P46094 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XCR1P46094 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XCR1P46094 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XCR1P46094 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XCR1P46094 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XCR1P46094 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XCR1P46094 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XCR1P46094 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XCR1P46094 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XCR1P46094 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XCR1P46094 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XCR1P46094 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XCR1P46094 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XCR1P46094 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XCR1P46094 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XCR1P46094 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XCR1P46094 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XCR1P46094 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XCR1P46094 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XCR1P46094 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XCR1P46094 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XCR1P46094 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XCR1P46094 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XCR1P46094 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XCR1P46094 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XCR1P46094 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XCR1P46094 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XCR1P46094 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XCR1P46094 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XCR1P46094 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XCR1P46094 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XCR1P46094 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XCR1P46094 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XCR1P46094 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XCR1P46094 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XCR1P46094 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XCR1P46094 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XCR1P46094 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XCR1P46094 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XCR1P46094 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XCR1P46094 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XCR1P46094 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XCR1P46094 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XCR1P46094 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XCR1P46094 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XCR1P46094 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XCR1P46094 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XCR1P46094 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XCR1P46094 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XCR1P46094 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XCR1P46094 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XCR1P46094 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XCR1P46094 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XCR1P46094 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XCR1P46094 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XCR1P46094 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XCR1P46094 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XCR1P46094 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XCR1P46094 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XCR1P46094 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XCR1P46094 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XCR1P46094 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XCR1P46094 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XCR1P46094 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XCR1P46094 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XCR1P46094 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XCR1P46094 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XCR1P46094 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XCR1P46094 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XCR1P46094 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XCR1P46094 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XCR1P46094 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
XCR1P46094 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XCR1P46094 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XCR1P46094 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XCR1P46094 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XCR1P46094 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XCR1P46094 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XCR1P46094 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XCR1P46094 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XCR1P46094 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XCR1P46094 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XCR1P46094 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XCR1P46094 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XCR1P46094 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XCR1P46094 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XCR1P46094 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XCR1P46094 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XCR1P46094 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XCR1P46094 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XCR1P46094 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XCR1P46094 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms