Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR4A2P43354 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NR4A2P43354 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR4A2P43354 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms