Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSKP43235 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSKP43235 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSKP43235 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSKP43235 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSKP43235 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSKP43235 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTSKP43235 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTSKP43235 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTSKP43235 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTSKP43235 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTSKP43235 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTSKP43235 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTSKP43235 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTSKP43235 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTSKP43235 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTSKP43235 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTSKP43235 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CTSKP43235 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSKP43235 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTSKP43235 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTSKP43235 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTSKP43235 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTSKP43235 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTSKP43235 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTSKP43235 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTSKP43235 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTSKP43235 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTSKP43235 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTSKP43235 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTSKP43235 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTSKP43235 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTSKP43235 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSKP43235 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSKP43235 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSKP43235 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CTSKP43235 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTSKP43235 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTSKP43235 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTSKP43235 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTSKP43235 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTSKP43235 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTSKP43235 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTSKP43235 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTSKP43235 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTSKP43235 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTSKP43235 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTSKP43235 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTSKP43235 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTSKP43235 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTSKP43235 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTSKP43235 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTSKP43235 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTSKP43235 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTSKP43235 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTSKP43235 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTSKP43235 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTSKP43235 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSKP43235 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSKP43235 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSKP43235 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSKP43235 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSKP43235 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSKP43235 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTSKP43235 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTSKP43235 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTSKP43235 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTSKP43235 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSKP43235 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSKP43235 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSKP43235 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSKP43235 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSKP43235 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSKP43235 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSKP43235 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSKP43235 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSKP43235 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSKP43235 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSKP43235 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSKP43235 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSKP43235 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSKP43235 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSKP43235 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSKP43235 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSKP43235 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSKP43235 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSKP43235 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSKP43235 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSKP43235 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSKP43235 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSKP43235 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSKP43235 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSKP43235 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSKP43235 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSKP43235 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSKP43235 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSKP43235 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSKP43235 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSKP43235 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSKP43235 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms