Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC1P41238 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOBEC1P41238 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms