Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 PTH2YBL057C 627 nt7.73□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 ERG27YLR100W 1044 nt7.72□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 YOX1YML027W 1158 nt7.72□□□□□ -1.17
SHQ1P40486 YJL213WYJL213W 996 nt7.71□□□□□ -1.18
SHQ1P40486 YLR112WYLR112W 420 nt7.7□□□□□ -1.18
SHQ1P40486 PHO85YPL031C 918 nt7.7□□□□□ -1.18
SHQ1P40486 DMC1YER179W 1005 nt7.69□□□□□ -1.18
SHQ1P40486 AIM2YAL049C 741 nt7.69□□□□□ -1.18
SHQ1P40486 ADH6YMR318C 1083 nt7.69□□□□□ -1.18
SHQ1P40486 SUN4YNL066W 1263 nt7.69□□□□□ -1.18
SHQ1P40486 PET117YER058W 324 nt7.68□□□□□ -1.18
SHQ1P40486 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.65□□□□□ -1.18
SHQ1P40486 CTA1YDR256C 1548 nt7.64□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 CIT2YCR005C 1383 nt7.64□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 PAC10YGR078C 600 nt7.64□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 YPQ1YOL092W 927 nt7.64□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 YPL067CYPL067C 597 nt7.64□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 RPL43AYPR043W 279 nt7.64□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 AFG2YLR397C 2343 nt7.64□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 SRF1YDL133W 1314 nt7.63□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 IRC5YFR038W 2562 nt7.63□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 HHY1YEL059W 309 nt7.63□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 MHP1YJL042W 4197 nt7.63□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 THR1YHR025W 1074 nt7.62□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 TRR2YHR106W 1029 nt7.62□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 YML122CYML122C 381 nt7.62□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 PRS4YBL068W 981 nt7.62□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 YPR127WYPR127W 1038 nt7.62□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 DPM1YPR183W 804 nt7.62□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 PPS1YBR276C 2424 nt7.61□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 PAM17YKR065C 594 nt7.61□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 AAD14YNL331C 1131 nt7.61□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 CST26YBR042C 1194 nt7.61□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 SNT309YPR101W 528 nt7.61□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 UME1YPL139C 1383 nt7.6□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 TDP1YBR223C 1635 nt7.6□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 CEM1YER061C 1329 nt7.6□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 YCR049CYCR049C 447 nt7.6□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 HPT1YDR399W 666 nt7.6□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 AIM46YHR199C 933 nt7.59□□□□□ -1.19
SHQ1P40486 MTR3YGR158C 753 nt7.58□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 YJL144WYJL144W 315 nt7.58□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 RTC4YNL254C 1206 nt7.58□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 YNL040WYNL040W 1371 nt7.58□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 YEL023CYEL023C 2049 nt7.57□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 NDE1YMR145C 1683 nt7.57□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 SEC23YPR181C 2307 nt7.57□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 DLD1YDL174C 1764 nt7.57□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 EFM1YHL039W 1758 nt7.57□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 YIL108WYIL108W 2091 nt7.57□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 MIX17YMR002W 471 nt7.57□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 MCP1YOR228C 909 nt7.57□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 AMN1YBR158W 1650 nt7.57□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 MSG5YNL053W 1470 nt7.56□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 DML1YMR211W 1428 nt7.56□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 ERS1YCR075C 783 nt7.56□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 YPQ2YDR352W 954 nt7.56□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 NFS1YCL017C 1494 nt7.55□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 KIN1YDR122W 3195 nt7.55□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 ARC35YNR035C 1029 nt7.55□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 MCH2YKL221W 1422 nt7.54□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 MRPL28YDR462W 444 nt7.54□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 CYS3YAL012W 1185 nt7.54□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 MBF1YOR298C-A 456 nt7.54□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 CYB2YML054C 1776 nt7.54□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 TUB1YML085C 1344 nt7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P40486 LGE1YPL055C 999 nt7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 GPH1YPR160W 2709 nt7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 NTG1YAL015C 1200 nt7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 YAL045CYAL045C 309 nt7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 CCT3YJL014W 1605 nt7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 CCR4YAL021C 2514 nt7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 MPE1YKL059C 1326 nt7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 GSH1YJL101C 2037 nt7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 PDA1YER178W 1263 nt7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 YOL099CYOL099C 492 nt7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 YPR130CYPR130C 408 nt7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 Q0010Q0010 387 nt7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 YBR241CYBR241C 1467 nt7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 PLB2YMR006C 2121 nt7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 SPE3YPR069C 882 nt7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 TAH11YJR046W 1815 nt7.48□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 FCP1YMR277W 2199 nt7.48□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 ZIM17YNL310C 525 nt7.48□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 YOR111WYOR111W 699 nt7.48□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 TUF1YOR187W 1314 nt7.48□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 RQC1YDR333C 2172 nt7.47□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 YJL045WYJL045W 1905 nt7.47□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 STF1YDL130W-A 261 nt7.47□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 PUS4YNL292W 1212 nt7.47□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 HBN1YCL026C-B 582 nt7.47□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 BRN1YBL097W 2265 nt7.47□□□□□ -1.21
SHQ1P40486 RPL2BYIL018W 765 nt7.46□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 YOR389WYOR389W 1875 nt7.46□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 GUT1YHL032C 2130 nt7.46□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 PLB3YOL011W 2061 nt7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 SML1YML058W 315 nt7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 GET4YOR164C 939 nt7.45□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.44□□□□□ -1.22
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