Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL3P39023 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL3P39023 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL3P39023 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL3P39023 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL3P39023 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL3P39023 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL3P39023 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL3P39023 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL3P39023 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL3P39023 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL3P39023 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL3P39023 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL3P39023 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL3P39023 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL3P39023 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL3P39023 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL3P39023 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL3P39023 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL3P39023 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL3P39023 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL3P39023 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL3P39023 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL3P39023 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL3P39023 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL3P39023 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL3P39023 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL3P39023 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL3P39023 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL3P39023 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL3P39023 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL3P39023 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL3P39023 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL3P39023 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL3P39023 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL3P39023 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL3P39023 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL3P39023 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL3P39023 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL3P39023 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL3P39023 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL3P39023 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL3P39023 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL3P39023 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL3P39023 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL3P39023 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL3P39023 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL3P39023 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL3P39023 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL3P39023 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL3P39023 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL3P39023 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL3P39023 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL3P39023 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL3P39023 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL3P39023 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL3P39023 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL3P39023 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL3P39023 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL3P39023 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPL3P39023 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPL3P39023 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL3P39023 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL3P39023 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL3P39023 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL3P39023 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL3P39023 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL3P39023 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL3P39023 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL3P39023 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL3P39023 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL3P39023 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL3P39023 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL3P39023 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL3P39023 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL3P39023 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL3P39023 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL3P39023 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL3P39023 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL3P39023 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL3P39023 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL3P39023 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL3P39023 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms