Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL4P36578 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL4P36578 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL4P36578 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL4P36578 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL4P36578 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL4P36578 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL4P36578 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL4P36578 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL4P36578 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL4P36578 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL4P36578 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL4P36578 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL4P36578 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL4P36578 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL4P36578 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL4P36578 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL4P36578 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL4P36578 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL4P36578 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL4P36578 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL4P36578 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL4P36578 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL4P36578 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL4P36578 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL4P36578 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL4P36578 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL4P36578 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL4P36578 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL4P36578 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL4P36578 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL4P36578 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL4P36578 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL4P36578 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL4P36578 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL4P36578 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL4P36578 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL4P36578 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL4P36578 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL4P36578 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL4P36578 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL4P36578 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL4P36578 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL4P36578 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL4P36578 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL4P36578 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL4P36578 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL4P36578 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL4P36578 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL4P36578 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL4P36578 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL4P36578 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL4P36578 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL4P36578 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL4P36578 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL4P36578 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL4P36578 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL4P36578 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL4P36578 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL4P36578 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL4P36578 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL4P36578 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL4P36578 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL4P36578 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL4P36578 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL4P36578 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL4P36578 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL4P36578 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL4P36578 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL4P36578 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL4P36578 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL4P36578 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL4P36578 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL4P36578 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL4P36578 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL4P36578 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL4P36578 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL4P36578 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL4P36578 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL4P36578 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL4P36578 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL4P36578 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL4P36578 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL4P36578 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL4P36578 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL4P36578 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL4P36578 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL4P36578 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL4P36578 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL4P36578 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL4P36578 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL4P36578 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL4P36578 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL4P36578 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL4P36578 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL4P36578 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL4P36578 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL4P36578 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL4P36578 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL4P36578 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms