Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGCLP35914 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGCLP35914 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGCLP35914 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGCLP35914 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGCLP35914 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGCLP35914 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGCLP35914 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGCLP35914 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGCLP35914 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGCLP35914 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGCLP35914 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HMGCLP35914 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMGCLP35914 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGCLP35914 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms