Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TSPOP30536 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSPOP30536 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TSPOP30536 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSPOP30536 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSPOP30536 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSPOP30536 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSPOP30536 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSPOP30536 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSPOP30536 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSPOP30536 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSPOP30536 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSPOP30536 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSPOP30536 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSPOP30536 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TSPOP30536 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSPOP30536 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TSPOP30536 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TSPOP30536 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TSPOP30536 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSPOP30536 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPOP30536 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPOP30536 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPOP30536 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPOP30536 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPOP30536 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPOP30536 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPOP30536 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSPOP30536 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPOP30536 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPOP30536 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPOP30536 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPOP30536 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPOP30536 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPOP30536 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPOP30536 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPOP30536 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPOP30536 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSPOP30536 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPOP30536 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPOP30536 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSPOP30536 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPOP30536 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPOP30536 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPOP30536 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPOP30536 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPOP30536 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPOP30536 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPOP30536 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPOP30536 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPOP30536 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPOP30536 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPOP30536 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPOP30536 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPOP30536 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPOP30536 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPOP30536 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPOP30536 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPOP30536 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPOP30536 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPOP30536 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPOP30536 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPOP30536 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPOP30536 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPOP30536 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPOP30536 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPOP30536 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPOP30536 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPOP30536 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPOP30536 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPOP30536 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPOP30536 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPOP30536 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPOP30536 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPOP30536 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPOP30536 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPOP30536 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPOP30536 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPOP30536 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPOP30536 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPOP30536 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPOP30536 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TSPOP30536 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPOP30536 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPOP30536 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPOP30536 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPOP30536 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPOP30536 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPOP30536 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSPOP30536 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSPOP30536 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSPOP30536 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSPOP30536 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSPOP30536 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSPOP30536 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSPOP30536 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSPOP30536 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSPOP30536 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSPOP30536 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSPOP30536 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms