Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECHS1P30084 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECHS1P30084 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECHS1P30084 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ECHS1P30084 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECHS1P30084 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms