Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA2P29317 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA2P29317 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA2P29317 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA2P29317 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms