Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VARSP26640 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VARSP26640 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VARSP26640 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VARSP26640 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VARSP26640 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VARSP26640 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VARSP26640 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VARSP26640 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VARSP26640 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VARSP26640 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VARSP26640 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VARSP26640 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VARSP26640 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VARSP26640 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VARSP26640 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VARSP26640 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VARSP26640 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VARSP26640 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VARSP26640 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VARSP26640 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VARSP26640 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VARSP26640 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VARSP26640 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VARSP26640 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VARSP26640 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VARSP26640 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VARSP26640 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VARSP26640 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VARSP26640 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VARSP26640 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VARSP26640 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VARSP26640 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VARSP26640 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VARSP26640 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VARSP26640 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VARSP26640 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VARSP26640 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VARSP26640 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VARSP26640 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VARSP26640 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VARSP26640 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VARSP26640 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VARSP26640 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VARSP26640 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VARSP26640 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VARSP26640 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VARSP26640 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VARSP26640 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VARSP26640 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VARSP26640 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VARSP26640 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VARSP26640 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VARSP26640 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VARSP26640 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VARSP26640 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VARSP26640 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VARSP26640 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VARSP26640 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VARSP26640 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VARSP26640 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VARSP26640 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VARSP26640 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VARSP26640 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VARSP26640 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VARSP26640 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VARSP26640 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VARSP26640 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARSP26640 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VARSP26640 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARSP26640 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARSP26640 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARSP26640 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARSP26640 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARSP26640 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARSP26640 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VARSP26640 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VARSP26640 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VARSP26640 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VARSP26640 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VARSP26640 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VARSP26640 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VARSP26640 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VARSP26640 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VARSP26640 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VARSP26640 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VARSP26640 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VARSP26640 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VARSP26640 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VARSP26640 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VARSP26640 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VARSP26640 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VARSP26640 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VARSP26640 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VARSP26640 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VARSP26640 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VARSP26640 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VARSP26640 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VARSP26640 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VARSP26640 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms