Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA3P26006 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA3P26006 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA3P26006 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms