Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA1P25391 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA1P25391 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMA1P25391 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 947.5 ms