Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND1P24385 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND1P24385 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND1P24385 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND1P24385 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCND1P24385 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND1P24385 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND1P24385 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND1P24385 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND1P24385 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND1P24385 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND1P24385 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCND1P24385 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCND1P24385 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCND1P24385 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCND1P24385 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCND1P24385 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCND1P24385 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCND1P24385 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCND1P24385 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCND1P24385 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCND1P24385 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND1P24385 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND1P24385 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND1P24385 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND1P24385 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCND1P24385 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND1P24385 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND1P24385 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND1P24385 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCND1P24385 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND1P24385 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND1P24385 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND1P24385 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND1P24385 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND1P24385 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND1P24385 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND1P24385 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND1P24385 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND1P24385 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCND1P24385 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND1P24385 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND1P24385 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCND1P24385 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND1P24385 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND1P24385 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND1P24385 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND1P24385 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND1P24385 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND1P24385 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND1P24385 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND1P24385 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND1P24385 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND1P24385 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND1P24385 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND1P24385 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND1P24385 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCND1P24385 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND1P24385 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND1P24385 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND1P24385 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCND1P24385 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND1P24385 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND1P24385 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND1P24385 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND1P24385 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND1P24385 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCND1P24385 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND1P24385 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND1P24385 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCND1P24385 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND1P24385 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND1P24385 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND1P24385 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND1P24385 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCND1P24385 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCND1P24385 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCND1P24385 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND1P24385 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND1P24385 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND1P24385 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND1P24385 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND1P24385 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND1P24385 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND1P24385 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND1P24385 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND1P24385 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCND1P24385 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCND1P24385 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCND1P24385 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCND1P24385 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCND1P24385 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND1P24385 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND1P24385 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND1P24385 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND1P24385 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND1P24385 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND1P24385 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND1P24385 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND1P24385 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms