Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AMPD1P23109 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AMPD1P23109 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AMPD1P23109 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMPD1P23109 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AMPD1P23109 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AMPD1P23109 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms