Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCMT1P22061 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCMT1P22061 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCMT1P22061 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCMT1P22061 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCMT1P22061 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms